やりたいことは
特定のファイル名を持つテキスト（一個だけ）を開く
その中身を検索する。検索後は例えば「application」

ヒットした後に文字列（例えば　"properties")を挿入

どうすればVBドットネットで達成できますか。

使っているのはmicrosoft visual basic 2010 expressで
OSは、　　Windows７です。
よろしくお願いします。

File.ReadAllTextでファイルの中身を全て取得
取得した文字列をReplaceで『application』から『applicationproperties』に置換
置換した文字列を一時ファイルにFile.AllWriteTextで保存
元のファイルを削除(File.Delete)
一時ファイルの名前変更(もしくはコピー＆削除)(File.Move)

という流れになると思います。
この流れで作ってみて分からない所を再度質問されるとよいかと思います。