IEが起動されている状態（アイコン化されていない）で、とあるアプリの閉じる
ボタン押下でアプリを終了させると、起動していたIEが最前面に出てきてしまい
ます。
もちろん閉じるボタンのイベント内にそのような処理は仕掛けておりません。
どういったことが考えられるでしょうか。

Form_Loadイベント内でSetWindowPos関数を使用しているのですが、
これが影響を及ぼすことは考えられますでしょうか。
アプリ終了時にタスクマネージャでプロセスIDが上から2番目の値の
プログラムがどうやら最善面に表示されたりします。